Depuis 1979, il existait à Saint-Eugène une messe selon le « novus ordo » – le missel de 1970 – célébrée en latin, suivant ainsi la volonté des pères du Concile Vatican II et du pape Paul VI, exprimées dans Sacrosanctum concilium.

En 1985, un motu proprio du pape Jean-Paul II accordait la faculté de célébrer la messe selon le « vetus ordo » – le missel de 1962, couramment appelée messe traditionnelle. Cette possibilité fut élargie à deux reprises, en 1988 et 2007.

A partir de 1985, la messe latine fut donc célébrée selon le missel de 1962, afin de répondre au souhait du pape. Les deux missels ont dès lors cohabité.

Si, dans les premiers temps, deux curés célébraient chacun un missel, il fut finalement nommé un seul curé, afin de lier la communauté pastorale autour d’un seul pasteur.

A la suite du motu proprio Traditionis custodes du pape François, Mgr Aupetit, alors archevêque de Paris, a conservé la célébration de la messe traditionnelle à Saint-Eugène. Son successeur, Mgr Ulrich, a conservé cette disposition.

Aujourd’hui les prêtres de Saint-Eugène – Sainte-Cécile célèbrent le dimanche régulièrement la messe selon les deux missels.
Le souci missionnaire reste le même : servir l’unité du diocèse de Paris, au bénéfice de tous les parisiens.